Αρμόδια όργανα για την ίδρυση, αναμόρφωση, οργάνωση και λειτουργία του Διατμηματικού Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΔΠΜΣ) σύμφωνα με το άρθρο 81 του N. 4957/2022 είναι:
α) η Σύγκλητος του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων,
β) η Επιτροπή Μεταπτυχιακών Σπουδών του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων
γ) η Επιτροπή Προγράμματος Σπουδών,
δ) η Συντονιστική Επιτροπή του ΔΠΜΣ,
ε) ο Διευθυντής του ΔΠΜΣ.
Η Συντονιστική Επιτροπή (ΣΕ) του ΔΠΜΣ είναι αρμόδια για την παρακολούθηση και τον συντονισμό της λειτουργίας του προγράμματος. Η ΣΕ στην οποία συμμετέχουν υποχρεωτικά ο Διευθυντής του ΔΠΜΣ και 4 από τα μέλη της Επιτροπής Προγράμματος Σπουδών έχει διετή θητεία.